MonaGO:一种新的基因本体富集分析可视化系统

谢谢你。

T1 - MonaGO

T2 -一种新型基因本体富集分析可视化系统

AU - Xin, Ziyin

AU - Cai, Yujun

AU - Dang, Louis T。

汉娜·伯克，M.S.

非盟-重新投票，Jerico

查里塔基斯，娜塔莉

比恩罗斯，丹尼斯

AU - Nim, Hieu T。

AU - Li, Yuan Fang

AU - Ramialison, Mirana

N1 -资金信息:我们感谢Cristina Keightley博士以及莫纳什生物信息学平台和Ramialison实验室的成员提供的宝贵反馈。我们感谢莫纳什电子研究平台对该服务器的支持金博宝188欢迎你。我们感谢专家用户研究的参与者(Yujing Gao, Oliver Trusler, Iris Milligan, Rishika Tugara, Rui Gao, Sherine Abraham和Zhitong Chen)提供的宝贵意见。资助信息:本工作由澳大利亚研究委员会发现项目资助:DP140100077 (y - f.l.)， DP140101067 (M金博宝188欢迎你.R.);澳大利亚再生医学研究所是由维多利亚州政府和澳大利亚政府资助的金博宝188欢迎你。澳大利亚再生医学研究所是由国家卫生与医学研究委员会/心脏基金会职业发展奖学金(1049980)和Sun基金会资助的。资助机构在研究的设计、数据的收集、分析和解释以及撰写手稿方面没有发挥任何作用。出版社版权所有:©2022，作者。

Py - 2022/2/14

Y1 - 2022/2/14

背景:基因本体(GO)富集分析经常在探索各种组学数据集的过程中进行。尽管生物学家可以使用各种各样的工具来进行这种分析，但仍然缺乏以易于解释的方式对过度代表的GO进行有意义的可视化。莫纳什基因本体(MonaGO)是一个新颖的基于网络的可视化系统，为执行氧化石墨烯富集分析和可视化结果提供了一个直观、交互和响应的界面。MonaGO支持基因列表和GO术语作为输入。可视化结果可以导出为高分辨率图像或在新的会话中恢复，允许分析的再现性。MonaGO和11个基于9个功能的最先进的GO丰富可视化工具之间的广泛比较表明，MonaGO是一个独特的平台，同时允许在一个输出页面内进行交互式可视化，通过带有可定制显示选项的web浏览器直接访问。结论:MonaGO结合了动态聚类和交互式可视化以及定制选项，以帮助生物学家获得过度表示的GO术语的有意义表示，以无偏的方式产生简化的输出。MonaGO将促进GO分析的解释，并将协助生物学家表示结果。

背景:基因本体(GO)富集分析经常在探索各种组学数据集时进行。尽管生物学家可以使用各种各样的工具来进行这种分析，但仍然缺乏以易于解释的方式对过度代表的GO进行有意义的可视化。莫纳什基因本体(MonaGO)是一个新颖的基于网络的可视化系统，为执行氧化石墨烯富集分析和可视化结果提供了一个直观、交互和响应的界面。MonaGO支持基因列表和GO术语作为输入。可视化结果可以导出为高分辨率图像或在新的会话中恢复，允许分析的再现性。MonaGO和11个基于9个功能的最先进的GO丰富可视化工具之间的广泛比较表明，MonaGO是一个独特的平台，同时允许在一个输出页面内进行交互式可视化，通过带有可定制显示选项的web浏览器直接访问。结论:MonaGO结合了动态聚类和交互式可视化以及定制选项，以帮助生物学家获得过度表示的GO术语的有意义表示，以无偏的方式产生简化的输出。MonaGO将促进GO分析的解释，并将协助生物学家表示结果。

KW -基因本体

KW - GO富集

KW -交互式可视化

KW -语义网

KW - Web服务

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85124808259&partnerID=8YFLogxK

U2 - 10.1186/s12859-022-04594-1

DO - 10.1186/s12859-022-04594-1

M3 -文章

C2 - 35164667

scopus:85124808259

Vl - 23

BMC生物信息学

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Sn - 1471-2105

是- 1

M1 - 69

呃- - - - - -